Orientointijärjestelmän toiminta hajautetaan laskemalla projektioiden vertailuja elektronimikroskooppikuviin niin monella eri prosessilla, kuin käyttäjä haluaa. Myös projektioiden tuottaminen voi muodostua pullonkaulaksi laskennassa. Tämän takia järjestelmä mahdollistaa myös niin monen prosessin käyttämisen projektioiden tuottamiseen, kuin käyttäjä haluaa.
Orientointijärjestelmän prosessit voidaan käynnistää käyttäjän määrittelemille koneille kukin erikseen.