Synkroninen viestintä on ainoa mekanismi, joka säätelee tiedon kulkua orientointijärjestelmän osien välillä ja tieto kulkee osien välillä vain yhteen suuntaan. Orientointijärjestelmän tiedostonlataajaprosessi lukee kaikki syötetiedostot ja lähettää tietoa muille prosesseille, jotka mahdollisesti käsittelevät tietoa jotenkin ja välittävät sen eteenpäin.
Lopulta laskennan tulokset tiivistyvät tulostenkerääjäprosessiin joka kerää parhaat tulokset kaikista verratuista projektioista ja elektronimikroskooppikuvista ja kirjoittaa tuloksia ajoittain levylle käyttäjää varten.
Tulosten kerääjä kirjoittaa myös käsiteltyjä projektiokulmia valmiit projektiokulmat -tiedostoon sitä mukaa kun projektiota on verrattu kaikkiin elektronimikroskooppikuviin ja tulokset on käsitelty. Tulostiedostoa ja valmiit projektiokulmat -tiedostoa voidaan käyttää laskennan uudelleenkäynnistämiseen, jos laskenta on jostain syystä keskeytynyt ennen valmistumistaan (katso Vikasietoisuus 8.3).