Probabilistiska metoder för analys av mikrochipsdata - Probabilistic Methods for Microarray Data Analysis (PMMA)
Tidsperiod: 1/2004-12/2005
Forskare: Petri Myllymäki, Jorma Rissanen, Teemu Roos, Hannes Wettig, Jussi Lahtinen, Tomi Silander
Finansiering: Tekes
Forskningen försöker utveckla nya probabilistiska metoder för dataanalys av mikrochips. Den koncentreras speciellt till följande delområden: avlägsning av störningar i mikrochipsbilder, utveckling av kompressionsestimationsmetoder (comprestimation), gengruppering och –klassificering, byggande av genjusteringsnätverk och utvärdering av resultaten. Forskningskonsortiet består av tre olika grupper: 1) Laboratoriet för beräkningsteknik, Tekniska högskolan (under ledning av TkD Jukka Heikkonen), 2) Biomedicinska institutionen; helsingfors universitet (under ledning av professor Tomi Mäkelä) och 3) Institutionen för datavetenskap, Helsingfors universitet (under ledning av professor Petri Myllymäki).
År 2005 utvecklade projektet en ny typ av metod för avlägsning av störningar i bilder vilken baserar sig på ”mjuk tröskelsättning” (soft thresholding). Dessutom skapades en distribuerad version av Bayes-verktyget (B-Course) som gruppen uvecklat tidigare. Med den nya versionen kan man analysera större datamängder än förut.
Projekt: Ontologier för den finländska semantiska webben (FinnONTO) - National Semantic Web Ontology Project in Finland (FinnONTO)
Tidsperiod: 9/2003-5/2007
Forskare: Eero Hyvönen, Olli Alm, Markus Holi, Miikka Junnila, Tomi Kauppinen, Ville-Pekka Komulainen, Teppo Känsälä, Tuukka Ruotsalo, Mirva Salminen, Satu Savia, Katri Seppälä, Arttu Valo, Anu Ylisalmi
Finansiering: AAC Global Ab, AlmaMedia Abp, Antikvaria-gruppen, TietoEnator Abp, Connexor Ab, Elisa Abp, Esbo stadsmuseum, Geologiska forskningscentralen GTK, Grip Studios Interactive Ab, Helsingfors stadsbibliotek, Nationalbiblioteket, Folkhälsoinstitutionen, Jord- och skogsbruksministeriet, Lantmäteriverket, M-Cult rf, Museiverket, Undervisningsstyrelsen, Opintoluotsi-projektet, Terminologicentralen TSK rf, Sininen meteoriitti Ab, Stakes, Finska Litteratursällskapet, Fonden för finska jordbruksmuseet, Finlands fotografiska museum, Tekes, TietoEnator Abp, Statens konstmuseum, Finansministeriet, Yleisradio Ab Forskningssamarbete: Tekniska högskolan, laboratoriet för medieteknik samt laboratoriet för kartografi och geoinformatik; Helsingfors universitet, institutionen för allmän språkvetenskap; Tammerfors universitet, institutionen för informationsvetenskaper
Projektet utvecklar grunderna för infrastrukturen för en finländsk semantisk webb som omfattar ontologier och metadataformater, ontologitjänster samt deras verktyg och processer.
För ontologiernas del har utvecklingen koncentrerats till en allmän finsk ontologi YSO (Yleinen suomalainen ontologia) som baserar sig på den allmänna finska terminologin YSA (Yleinen suomalainen asiasanasto), samt många andra ontologier. Användningen av ontologier gör det möjligt att utnyttja värdefulla datainnehåll över datanät mera effektivt än förr. Projektet utarbetar bl.a. ontologibiblioteket ONKI och därmed förknippade webbtjänster för den distribuerade utvecklingen och användningen av ontologier för en nationellt betydande semantiskt webb. Målet är att övergå från dagens termteknik till den semantiskt mångsidigare ontologitekniken för indexering och sökning. Ontologier ger mera användarvänliga metoder för exakt informationsutvinning, semantisk samordning av datasystem och intelligent service på webben. Teknologin tillämpas för konkreta case-tillämpningar. Dessa omfattar MuseoSuomi-systemet (MuseumFinland) för museiväsendet och den semantiska publiceringsplattformen KulttuuriSampo (KulturSampo) som har utvecklats på basen av det, en portal för främjandet av folkhälsan, en metasökmaskin och ett fråge- och svarssystem för biblioteksväsendet, samt en semantisk portal som skall utvecklas för undervisningsväsendet.
Tilläggsinformation och demonstrationer: http://www.seco.tkk.fi/projects/finnonto/index.fi.php
Projekt: Intelligenta webbtjänster - Intelligent Web Services (IWebS)
Tidsperiod: 8/2003-7/2005
Forskare: Eero Hyvönen, Markus Holi, Mikko Laukkanen, Petri Lindgren, Eetu Mäkelä, Samppa Saarela, Teemu Sidoroff, Kim Viljanen
Finansiering: Fonecta Ab, Stakes, Tekes, TeliaSonera Finland Abp, TietoEnator Abp, finansministeriet
Projektet utvecklade tekniken för den semantiska webben och webbtjänster inom tillämpningsområdet tjänster av typ intelligenta gula sidor samt semantiska portaler.
Projektets resultat omfattar bl.a. en modell för semantisk beskrivning av tjänster, en mängd ontologier som behövs för beskrivningen av tjänster, samt OntoViews-verktyget för utveckling av semantiska portaler. Tekniken tillämpas inom tre pilotprojekt. Inom delområdet eCommerce färdigställdes ett produkt- och tjänstregister av typ gula sidorna: tillämpningsprototypen Veturi som baserar sig på materialet i Fonect Ab:s 020202.fi-tjänstregister. För delområdet eGovernment utgjorde semantiska portaler de huvudsakliga forsknings- och utvecklingsobjekten. Projektet utvecklade en semantisk prototyp av finansministeriets Suomi.fi-portal, som riktar sig till allmänheten. Prototypen använder sig av ontologibaserad sökning från flera vyer, samt automatisk sammankoppling med hjälp av logisk slutledning av heterogent datainnehåll som producerats av olika organisationer. Inom delområdet eHealth studerade man ontologitekniker speciellt för beskrivning av hälsotjänster för äldreomsorg. En mängd allmänna hälsovårdstjänster konverterades till ontologisk form och förenades med materialet av typ gula sidorna i Veturi-portalen.
Tilläggsinformation: http://www.seco.tkk.fi/projects/iwebs/