Forskning
Biomine-projektet arbetar med att framställa biologiska databaser i form av nätverk, där noderna motsvarar koncept (t.ex. gen, biologisk process) och bågarna relationerna mellan koncepten. Projektet siktar på att utveckla metoder för att finna tidigare okända relationer, med andra ord för att framställa nya biologiska hypoteser.
All forskning vid universitetet utvärderades under 2005. Forskningen vid institutionen för datavetenskap och den därmed knutna basforskningsenheten vid HIIT samt institutionen för matematik och statistik utvärderades tillsammans av en internationell panel. Utvärderingen startade på våren, då en massiv självvärderingsrapport åtföljd av vetenskapliga publikationer ställdes till panelens förfogande. Panelen gästade universitetet i september, då den under en veckas tid intervjuade representanter för enheterna och skissade upp sina egna utvärderingsrapporter.
Rapporten över forskningsutvärderingen publicerades 1/3 2006. Av de 75 enheter vid Helsingfors universitet som utvärderades fick 20 enheter det högsta vitsordet (7), bland dem fanns både institutionen för datavetenskap och Forskningsinstitutet för informationsteknologi HIIT. Eftersom dessutom matematisk-naturvetenskapliga fakulteten var den överlägset bästa i utvärderingen av fakulteter kan man anse att forskningen vid institutionen obestridligen ligger på toppnivå internationellt sett.