Tutkimusprojektit
Älykkäät järjestelmät
Probabilistiset menetelmät mikrosirudata-analyysissä - Probabilistic Methods for Microarray Data (PMMA)
Ajankohta: 1/2004-12/2005
Tutkijat: Petri Myllymäki, Jorma Rissanen, Teemu Roos, Hannes Wettig, Jussi Lahtinen, Tomi Silander
Rahoitus: Tekes
Tutkimuksen tavoitteena on kehittää uusia probabilistisia menetelmiä mikrosirudata-analyysiin. Tutkimus keskittyy erityisesti seuraaviin osa-alueisiin: mikrosirukuvien kohinan poisto, kompressioestimaatiomenetelmien (comprestimation) kehittäminen, geenien ryhmittely ja luokittelu, geenisäätelyverkkojen rakentaminen ja tulosten hyvyyden arviointi. Tutkimuskonsortio kostuu kolmesta osaryhmästä: 1) Laskennallisen tekniikan laboratorio, Teknillinen korkeakoulu (vast. johtaja TkT Jukka Heikkonen), 2) Biolääketieteen instituutti, Helsingin yliopisto (vast.johtaja professori Tomi Mäkelä) ja 3) Tietojenkäsittelytieteen laitos, Helsingin yliopisto (vast.johtaja professori Petri Myllymäki).
Vuonna 2005 projektissa kehitettiin uudentyyppinen "pehmeään kynnystykseen" (soft thresholding) perustuva kuvien kohinanpoistomenetelmä. Lisäksi ryhmän kehittämästä Bayes-verkkotyökalusta (B-Course) tuotettiin hajautettu versio jolla voidaan analysoida entistä suurempia datajoukkoja.
Suomalaiset semanttisen webin ontologiat (FinnONTO) - National Semantic Web Ontology Project in Finland (FinnONTO)
Ajankohta: 9/2003-5/2007
Tutkijat: Eero Hyvönen, Olli Alm, Markus Holi, Miikka Junnila, Tomi Kauppinen, Ville-Pekka Komulainen, Teppo Känsälä, Tuukka Ruotsalo, Mirva Salminen, Satu Savia, Katri Seppälä, Arttu Valo, Anu Ylisalmi
Rahoitus: AAC Global Oy, AlmaMedia Oyj, Antikvaria-ryhmä, TietoEnator Oyj, Connexor Oy, Elisa Oyj, Espoon kaupunginmuseo, Geologian tutkimuskeskus GTK, Grip Studios Interactive Oy, Helsingin kaupunginkirjasto, Kansalliskirjasto, Kansanterveyslaitos, Maa- ja metsätalousministeriö, Maanmittauslaitos, M-Cult ry, Museovirasto, Opetushallitus, Opintoluotsiprojekti, Sanastokeskus TSK ry, Sininen meteoriitti Oy, Stakes, Suomalaisen kirjallisuuden seura, Suomen maatalousmuseosäätiö, Suomen valokuvataiteen museo, Tekes, TietoEnator Oyj, Valtion taidemuseo, Valtiovarainministeriö, Yleisradio Oy Tutkimusyhteistyö: Teknillinen korkeakoulu, viestintätekniikan laboratorio ja kartografian ja geoinformatiikan laboratorio; Helsingin yliopisto, yleisen kielitieteen laitos; Tampereen yliopisto, informaatiotieteiden laitos
Hankkeessa kehitetään perustaa suomalaisen semanttisen webin infrastruktuurille, johon kuuluvat ontologiat ja metadataformaatit, ontologiapalvelut sekä näihin liittyvät työvälineet ja prosessit.
Ontologioiden osalta kehityskohteena on oolut Yleiseen suomalaiseen asiasanastoon YSA perustuva Yleinen suomalainen ontologia YSO sekä useita muita ontologioita. Ontologioiden käyttö mahdollistaa arvokkaiden tietosisältöjen aiempaa tehokkaamman hyötykäytön tietoverkoissa. Ontologiapalveluiden osalta kehitetään mm. ontologiakirjastopalvelinta ONKI ja siihen liittyviä web-palveluita kansallisesti merkittävien semanttisen webin ontologioiden hajautettua kehitystyötä ja hyödyntämistä varten. Tavoitteena on siirtyä tiedon indeksoinnissa ja haussa nykyisestä asiasanatekniikasta semanttisesti rikkaampaan ontologiateknologiaan, mikä mahdollistaa aiempaa käyttäjäystävällisemmän täsmätiedonhaun, tietojärjestelmien semanttisen yhteentoimivuuden ja älykkäät palvelut webissä. Teknologiaa sovelletaan konkreettisissa case-sovelluksissa. Näitä ovat museoalan MuseoSuomi-järjestelmä, siitä edelleen kehitettävä suomalaisen kulttuurin semanttinen julkaisualusta KulttuuriSampo, Kansalaisen terveyden edistämisen portaali, kirjastoalan metahakukone ja kysymys-vastaus-järjestelmä sekä opetusalalle kehitettävä semanttinen portaali.
Lisätietoja ja demonstraatioita: http://www.seco.tkk.fi/projects/finnonto/index.fi.php
Älykkäät web-palvelut - Intelligent Web Services (IWebS)
Ajankohta: 8/2003-7/2005
Tutkijat: Eero Hyvönen, Markus Holi, Mikko Laukkanen, Petri Lindgren, Eetu Mäkelä, Samppa Saarela, Teemu Sidoroff, Kim Viljanen
Rahoitus: Fonecta Oy, Stakes, Tekes, TeliaSonera Finland Oyj, TietoEnator Oyj, valtiovarainministeriö
Hankkeessa kehitettiin semanttisen webin ja web-palveluiden teknologiaa sovellusalueena älykkäät keltaiset sivut -tyyppiset palvelut ja semanttiset portaalit.
Hankkeen tuloksia olivat mm. malli palveluiden semanttisesta kuvaamisesta, joukko palveluiden kuvaamisessa tarvittavia ontologioita sekä semanttisten portaalien kehittämiseen tarkoitettu OntoViews-työkalu. Teknologiaa sovellettiin kolmessa pilottihankkeessa. eCommerce-alueen sovellusprototyyppinä valmistui keltaiset sivut -tyyppinen tuote- ja palveluhakemisto Veturi, joka perustuu Fonecta Oy:n 020202.fi-palveluhakemiston aineistoon. eGoverment-alueella tutkimus- ja kehityskohteena olivat semanttiset portaalit. Valtiovarainministeriön kansalaisille suunnatusta Suomi.fi-portaalista kehitettiin semanttinen prototyyppi, jossa hyödynnettiin ontologiaperustaista moninäkymähakua ja eri organisaatioiden tuottamien hetorogeenisten tietosisältöjen automaattista yhdistämistä loogisen päättelyn avulla. eHealth-alueella tutkittiin ontologiatekniikoita erityisesti vanhusten terveyspalveluiden kuvaamisessa. Joukko julkisia terveyspalveluita muunnettiin ontologiseen muotoon ja yhdistettiin Veturi-portaalin keltaiset sivut -aineistoihin.
Lisätietoja: http://www.seco.tkk.fi/projects/iwebs/