Orientointijärjestelmän käyttäjät ovat virusten rekonstruktioprosessin parissa työskenteleviä biologeja ja tietojenkäsittelytieteilijöitä. Koska järjestelmä tarjoaa käyttäjilleen vain yhden palvelun, kaikki järjestelmän käyttäjät kuuluvat samaan sidosryhmään. Orientointijärjestelmän ja sidosryhmän suhde on esitetty kuvassa .