Tässä yksittäisen vertailun suorittaa yksi määrätty prosessori, samalla kun muut prosessorit suoritavat toisia vertailuja. Koska yhteen vertailuun tarvitaan yksi projektio ja yksi elektronimikroskooppikuva ja elektronimikroskooppikuvien määrä on useita satoja ja projektioiden määrä useita satoja tuhansia, on olemassa ilmeisiä vaihtoehtoja vertailujen jakamiseen.