Generaattorin rakenne


1. Parseri
  1a. Mallin lukeminen
	-Parseri lukee mallia rivi kerrallaan
	-Rakenteet havaintaan '{' ja '}' merkeistä
	-Jos luetaan rakenne, luodaan Entity olio
		-Entity olio ja sen nimi lisätään HashMap<String, Entity> tyyppiseen olioon
	-Jos luetaan muuttujan määritys, luodaan Variable olio
		-Nimi, onko dataa, onko funktionaalinen, mihin entityyn se liittyy, millä rivillä datassa, mikä sen yhtälö on?
	-Jos variable olio on rakenteen sisällä, lisätään se kyseiseen entity olioon
	-Lopuksi Entity oliot linkitetään kutsumalla niille link(HashMap<String, Entity> mapper) metodia

  1b. Simulointiteknisten parametrien lukeminen
	-Globaalit asetukset luetaan muuttujiin
	-Ehdotusjakaumat, kierrosten lukumäärä, algoritmi, jne, luetaan Variable olioihin
		-Tiedostosta luetaan rivi, josta selvitetään muuttujan nimi
		-Variable listoista etsitään oikea olio nimen perusteella
		-Oliota ei löydy -> virheilmoitus
		-Ehdoitusjakaumat talletetaan Distribution olioina!

  1c. Datan läpikäyminen
	-Käydään entity oliot läpi
	-Jokaisen datatiedoston pituus käydään läpi ja tämä lisätään Entity olioon
	-Samaan aikaan puuttuvat arvot korvataan nollilla ja kirjoitetaan uutta binäärimatriisia...
	-Sarakkeista lasketaan montako arvoa puuttu
	-Lopuksi Entity olioon liittyviin Variable olioihin päivitetään puuttuvien muuttujien lukumäärä
 
  1d. Kokoojaolion luominen
	-Luodaan kokoojaolio (entity ja variable kokoelmat, globaalit sim.tek. parametrit)

2. Jakaumaolioiden luonti (tämä täytyy tehdä ennen parsetusta!!!)
	-NAGin jakaumille luodaan oliot
	-Käyttäjän omille jakaumille luodaan oliot (?)

3. Linkitys ja Fortran lausekkeiden luonti

  3a. -Variable oliot käydään läpi ja linkitetään

		!-Selvitä ehdotusjakauma ja korvaa... ("proposal" kenttä)
		!	-Etsi jakaumaolio nimen perusteella, kovakoodaa...
		!	-Jakaumaoliolta saadaan laskutoimitus

		-Jos muuttuja on stokastinen
			-Selvitetään pistetodennäköisyys jakauma nimen perusteella
			-Luodaan kyseisen jakauman olio
			-Käydään Variable oliot läpi ja etsitään riippuvuudet parametrien nimien perusteella
			-Affects kenttien päivitykset (!)
			-Lisätään jakauman olioon linkit parametreihin

			!-Spatiaalisuus erikoistapauksena
			!	-Spatiaalisuus linkitettynä listana (?) fortranissa
			!	-For silmukka tai jotain...

		-Jos muuttuja on funktionaalinen 
			(-Korvataan ^ merkki **:llä, e^... korvataan exp(...))
			-Selvitetään mistä muuttujista olio riippuu
				-Käydään Variable-oliot läpi ja etsitään riippuvuudet nimen perusteella
				-Affects ja Depends kenttien päivitykset (!)

  3b. Hyväksymisuskottavuuden muodostaminen tapahtuu näin. Huom tämä tehdään myöhemmin (olkoon muutuja t)

	-Variable luokan metodi generoi tämän{
		-P(t') ja P(t) muodostetaan jakaumaolion avulla
		-käydään "Affects" linkit läpi
			-Jos Kyseesä on stokastinen muuttuja
				-Muodosta P(...|..., t', ...) ja P(...|..., t, ...) jakaumaolion avulla
				-Selvitä onko muuttuja globaali/sarake/matriisi...
			-Jos kyseessä on funktionaalinen muuttuja
				-Muodosta laskukaava (korvaa viitteet oliohin...) (???)
				-Seuraa "Affects" linkkiä ja toista...
		-Kokoa laskukaava ja palauta se !!! Algoritmi !!!
	}

	-Jokin generaattorin metodi tekee tämän{
			-Generoi ehdoitus (Variable oliosta saadaan Distribution olio)
			-Todennäköisyys (muodostetaan jakaumaolion avulla, kutsuu metodia)
			-Arvo randomi luku
			-Katso päivitetäänkö
			-Päivitä jos päivitetään
			-Seuraa "affects" linkkiä ja päivitä kaikki funktionaaliset muuttujat
	}

4. Fortran ohjelman tietorakenteiden koodaaminen
	-Entity olio kertoo tarvittavan taulukon koon
	-Variable olion puutuvat arvot kenttä... (datalle)
	- ...

5. Alkuarvojen, datan, spatiaalisen matriisin lukemisen koodaaminen
	-Data
	-Alkuarvo
	-Spatiaalisuus
	-Puuttuvat arvot datassa!

6. Päivitys-strategian koodaaminen
	-Helppo, 2 vaihtoehtoa

7. Ehdotuksien + päivittämisen koodaaminen
  7a. Random
	-Päivitettävä muuttuja arvotaan
	-Switch lauseke
		-Generointi, uskottavuuden laskeminen, randomi luku, päivitetäänkö?, funktionaaliset muutujat
			-Jokin metodi tekee tämän
  7b. Järjestyksessä
	-Käydään jokainen taulukko järjestyksessä läpi
	-Jokaiseen taulukon läpikäyntiin liittyy oma ehdotus + uskottavuus...
	-Laskeminen samalla tapaa...

8. Tulostuksen koodaaminen